À 8 ans, il émigre avec sa famille en Estrémadure. Il y fait ses études secondaires, d'abord chez les Pères Salésiens puis chez les Franciscains.
À 16 ans il quitte sa famille pour s'installer à Madrid, sans argent et sans travail, mais avec un projet très concret : étudier le cinéma et en faire. Impossible de s'inscrire à l'école officielle du cinéma, Franco vient juste de la fermer. Dans la mesure où il ne peut en apprendre le langage, il décide d'en apprendre le fond, c'est-à-dire la vie, vivre… Malgré la dictature qui asphyxie le pays, Madrid représente, pour un adolescent provincial, la culture, l'indépendance et la liberté. Il fait de nombreux petits boulots mais il ne pourra s'acheter sa première caméra super 8 qu'après avoir décroché un emploi « sérieux » à la Compagnie nationale de téléphone d'Espagne. Il y travaille 12 ans comme employé de bureau, 12 années partagées entre de nombreuses activités qui contribuent à sa véritable formation en tant que cinéaste et en tant que personne. Le matin, à la Compagnie de téléphone, il apprend à connaître la classe moyenne espagnole qui vit les débuts de la société de consommation, avec ses grands drames et ses petites misères, un bon filon pour un futur narrateur. Le soir et la nuit, il écrit, aime, fait du théâtre avec la mythique compagnie indépendante Los Goliardos, tourne des films en super 8 (sa seule école de cinéma).
Il collabore à diverses revues underground, écrit des nouvelles dont certaines sont publiées. Il a aussi réalisé des photo-roman au cours de sa jeunesse. Il a même fait partie d'une troupe de théâtre amateur (référence au film Tout sur ma mère) et il a même fait parti d'un band punk-rock avant de commencer sa carrière en cinéma.
En 1986, il fonde avec son frère Agustín la maison de production "El Deseo S.A." ; depuis cette date, ils ont produit les 10 films suivants que Pedro a dirigés et écrits, en plus des films d'autres jeunes réalisateurs. L'année 2003 a été l'une des meilleures pour "El Deseo S.A.".
Son premier film est remarqué et le succès va croissant bien qu'il soit beaucoup critiqué à ses débuts. Ses premiers films sont des comédies de mœurs un peu déjantées mais efficaces, on le taxe de vulgarité mais Almodovar va s'imposer en figure de la Movida dans son pays avant de surprendre et de changer de style avec le touchant Parle avec elle en 2001.
Femmes au bord de la crise de nerfs (1988) lui offre une notoriété internationale, et Tout sur ma mère (1999) des dizaines de prix et la reconnaissance qui va avec.
Une de ses actrices favorites est Victoria Abril que ses films ont imposée comme actrice majeure en France.
Dernièrement, Almodovar a réalisé le film Volver. Ce film est un véritable chef d'oeuvre cinématographique. L'actrice principale est Pénélope Cruz, cette actrice se retrouve aussi dans la production du film Tout sur ma mère.
Depuis quelques années, il fait partie des cinéastes qui concilient succès populaire et cinéma d'auteur, anticonformisme et indépendance avec un cinéma qui reste malgré tout populaire.
Il a été président du Jury au Festival de Cannes.
Filmographie
1980 : Pepi, Luci, Bom et les autres filles du quartier
1982 : Le Labyrinthe des passions
1983 : Dans les ténèbres
1984 : Qu'est-ce que j'ai fait pour mériter ça ?
1986 : Matador
1987 : La Loi du désir
1988 : Femmes au bord de la crise de nerfs
1990 : Attache-moi !
1991 : Talons aiguilles
1993 : Kika
1995 : La Fleur de mon secret
1997 : En chair et en os
1999 : Tout sur ma mère
2002 : Parle avec elle
2004 : La Mauvaise Éducation
2006 : Volver
2007 : La Piel Que Habito